Fig.1 高质量的原始数据
 
1. 转录组测序PE100,91.4%以上的碱基质量超过Q30(Fig.1);平均Q30大于85%。2. 已完成10万余份中华骨髓库样品的检测,内部抽检正确率100%,卫生部临检中心室间比对正确率100%,国际 UCLA DNA Exchange能力验证100%。3. 建库使用Illumina原装试剂盒,最新版的Truseq试剂,有效降低GC bias,有效提高base calling准确性。4. 实验室通过标准化认证,具有中国合格评定国家认可委员会实验室认可证书。深厚的生物信息学背景,强大的数据分析能力,丰富的项目经验,为客户提供众多定制/个性化测序分析服务。已与几十所单位合作,完成超过32个物种的各类测序服务。14份样品50个工作日42份样品70个工作日技术支持团队自成立以来,10年间一直秉承着诚信、严谨、专业的工作原则,为客户提供最全面周到的农业和医学领域的全方位服务;毕业于清华大学、中国科学院等知名院校的8位相关专业博士,其一丝不苟、兢兢业业的服务态度,深受业内认可。
 
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• 外显子捕获测序促销价低至13500元/样品!!!! • ChIP-seq、MeDIP-seq、microRNA测序、转录组测序等更有更多优惠和惊喜! 以上所有测序服务类型,单笔合同金额大于20万,送iPad Mini或同等价位投影仪。 

实施细则: 1. 促销时间:即日起至2013年7月31日。2. 执行条件:样品数量不少于6个,且同一批完成实验。在活动时间内签订合同并于15个工作日内支付80%预付款。\"博奥晶典二维码.jpg\"3. 具体详情请咨询当地销售或邮件bioservice@capitalbio.com咨询。4. 扫一扫,更多惊喜等着你!  5. 活动最终解释权归博奥生物有限公司所有。

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博奥生物测序服务大类和已完成的测序物种如下:

转录组(de novo)测序       比对unigene做差异表达分析,功能注释,功能分类,GO,KEGG pathway分析,并对ORF(开放性阅读框)进行分析。(Fig.2&3)

Fig.2 Unigene长度分布

Fig.3 ORF预测

转录组 (reference)测序:       比对到转录本/基因上做差异表达分析,功能注释,功能分类,GO,KEGG pathway分析,可变剪切分析,基因融合及cSNP鉴定等。(Fig. 4)

Fig.4 可变剪切结构体

Small RNA测序:       可进行Known miRNA、Conserved miRNA和Novel miRNA的鉴定,表达差异分析,miRNA靶基因的预测及其功能注释、pathway和GO显著性富集分析。(Fig. 5)

 

Fig.5 miRNA长度分布统计

 

MeDIP-Seq       结合基因组的CpG岛预测结果和检测到的peaks (Fig.6),做差异表达分析和功能注释,功能分类。包括GO,KEGG pathway分析。

Fig.6 甲基化区域分布统计

外显子测序:       鉴定SNVs和indels, 并对SNVs、indels进行相关基因的注释;同时查找样本间差异的SNVs/indels。(Fig.7)

Fig.7 SNPs及Indels在基因组上的分布统计

• Zhang G, Guo G, Hu X, et al ..Deep RNA sequencing at single base-pair resolution reveals high complexity of the rice transcriptome. Genome Res, 2010; 20:646-654.• Cirulli ET, Singh A, Shianna1 KV.. Screening the human exome: a comparison of whole genome and whole transcriptome sequencing. Genome Biol, 2010; 11:R57.• Palanisamy N, Ateeq B, Kalyana-Sundaram S, et al .. Rearrangements of the RAF kinase pathway in prostate cancer, gastric cancer and melanoma. Nature Med, 2010; 16:793-798.• Yan XJ, Xu J, Gu ZH, et al .. Exome sequencing identifies somatic mutations of DNA methyltransferase gene DNMT3A in acute monocytic leukemia. Nat Genet, 2011; 43: 309-315.• Goudie D, Alessandro MD, Merriman B, et al .. Multiple self-healing squamous epithelioma is caused by a diseasespecific spectrum of mutations in TGFBR1. Nat Genet, 2011; 43:365-371.• Ruike Y.,et al .. Genome-wide analysis of aberrant methylation in human breast cancer cells using methyl-DNA immunoprecipitation combined with high-throughput sequencing. BMC Genomics, 2010; 11:137
 
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